studierte an der königlich Dänischen Musikakademie und an der Universität in Kopenhagen Chor- und Orchesterdirigieren, sowie Gesang, Gesangspädagogik und Musikwissenschaften und schloss mit dem „Master of Arts“ ab. Postgraduale Kurse absolvierte er u. a. bei Sergiu Celibidache und Eric Ericson.
Morten Schuldt-Jensen arbeitet regelmäßig mit dem RIAS-Kammerchor, dem MDR-Rundfunkchor und dem NDR-Chor, der Akademie für Alte Musik (Berlin), dem Gewandhausorchester Leipzig und dem Helsingborgs Symfoniorkester und immer wieder mit dem DR Radiokoret und dem Philharmonischen Orchester Kopenhagen.
Als Chor-Master ist er für international angesehene Dirigenten wie Sir Simon Rattle, Herbert Blomstedt, Philippe Herreweghe, Vladimir Ashkenazy, Lothar Zagrosek, Sir Colin Davis und viele andere tätig.
1999-2006 war er Chordirektor am Gewandhaus zu Leipzig. In dieser Funktion gründete er 2001 den international viel beachteten GewandhausKammerchor, der sich heute Immortal-Bach-Ensemble nennt. Im Jahr 2000 übernahm er die künstlerische Leitung des Leipziger Kammerorchesters, das unter seinem künstlerischen Credo ein neues Profil entwickeln konnte. Ein vielfältiges und zum Teil vergessenes Repertoire, sicheres Stilempfinden und interpretatorische Vielseitigkeit kennzeichnen die Zusammenarbeit mit beiden Ensembles und sind durch etliche Aufnahmen und Rundfunkübertragungen belegt. Als sichtbarer Beweis seiner dirigentischen Verdienste, gewann Morten Schuldt-Jensen verschiedene Preise und Awards.
In seinem Heimatland gründete er 1984 und leitet seither den Sokkelund Sangkor, einen wichtigen europäischen Kammerchor, mit dem er zahlreiche Auszeichnungen erhielt und auch international hochgelobte CD-Aufnahmen produzierte, sowie den symphonischen „Tivoli Concert Choir“.
Ein weiteres wichtiges Arbeitsfeld Morten Schuldt-Jensens ist die Hochschultätigkeit: 1992 war er Associate Professor am Königlich Dänischen Musikkonservatorium Kopenhagen, 2001-2006 war er Dozent an der Hochschule für Musik und Theater "Felix Mendelssohn Bartholdy" in Leipzig. 2006 folgte er dem Ruf als Professor für Chor- und Orchesterdirigieren an die Staatliche Musikhochschule Freiburg.
Als Chor- und Orchesterdirigent ist Morten Schuldt-Jensen in bekannten Konzerthäusern und bei den renommierten europäischen Musikfestivals zu Gast, so im Gewandhaus, in der Thomaskirche zu Leipzig, in der Berliner Philharmonie, beim Rheingau Musik Festival, beim Schleswig-Holstein-Festival, den Festspielen Mecklenburg-Vorpommern, beim MDR-Musiksommer, dem Bachfest und den Mendelssohn-Festtagen in Leipzig, sowie dem Seoul International Music Festival in Korea, in der Kioi Hall in Tokyo, aber auch auf Tourneen durch Deutschland, Frankreich, Italien, Spanien, Japan und natürlich Skandinavien.
